




【中新網】中科院超算環境廣州分中心助破解多項生命科學密碼
中新社廣州10月20日電 題:中科院超算環境廣州分中心助破解多項生命科學密碼
作者 王堅
10月20日,記者在中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院(下稱“廣州健康院”)的中國科學院超算環境廣州分中心(下稱“超算中心”)的機房看到,一臺超級計算機正在高速運轉。該研究院的科學家通過它,破解了生命科學、公共健康等領域的多個重要科學密碼。

科研人員在中國科學院超算環境廣州分中心內的機房內工作。 中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院 供圖
2020年1月,新冠肺炎疫情暴發后,當大批醫護人員奔赴疫情防控第一線時,當廣州健康院的科學家開始科研攻關時,超算中心的工程師也迅速集結,維護超算高性能集群不間斷、高速穩定運行,保障新冠病毒多種測序數據的高效分析,幫助科學家在短期內發現新冠病毒感染導致急性呼吸窘迫癥細胞機理,對臨床治療具有重要指導意義。
“過去一年來,超算中心支撐干細胞先導專項、國家重點研發計劃及省市專項項目超200項。”中國科學院超算環境廣州分中心主任陳朝明20日接受媒體采訪時表示,在2019年的指數排名中,該中心在中科院各超算分中心中位列第一名;同時,該中心的超級計算機憑借著強勁、高效的計算能力,在干細胞與再生醫學、創新藥物設計等領域均有所應用。
陳朝明介紹,該中心目前集群擁有60臺普通刀片計算節點、1000個CPU計算核心、全系統內存容量6TB、存儲總容量達到3PB、整體聚合計算能力理論峰值達每秒100萬億次;主要應用在生物學、基礎醫學、生物醫學工程、藥學等13個領域,用戶覆蓋約30個科研組,最多時有逾百名分析人員同時在線進行提交作業計算。

科研人員在中國科學院超算環境廣州分中心內的機房內工作。 中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院 供圖
“生物學實驗、尤其是藥物研發,涉及的數據量大、算力要求高,基于AI技術構建完整的生物醫藥計算平臺,對于健康數據管理、藥物設計等科研活動具有極大的價值,高效穩定的網絡和數據支撐也是重中之重。”中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員劉勁松說。
中國科學院計算機網絡信息中心研究員金鐘表示,廣州健康院重視超算對科研創新的驅動,基于該超算分中心,產出了一批重大科研項目及重大成果,培養了一批生物醫藥計算交叉學科人才。
超算中心相關負責人表示,隨著高通量和單細胞測序技術的不斷發展,干細胞與再生醫學、藥物設計、公共健康與免疫等領域產生大規模數據,對于計算資源和計算能力的需求越來越大,該中心正不斷助力廣州健康院細胞命運調控、遺傳發育、抗癌藥物篩選及蛋白質結構解析等方向的數據分析,大大提升了科研效率。
中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院院長陳新文表示,超算中心將以參與新一代超級計算機研制、承擔人類細胞譜系大科學設施建設、粵港澳科創中心建設等重大任務為契機,充分發揮超算中心作用,為該院產出大成果提供更強力的基礎支撐。(完)