近日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院鮑習琛團隊在The Innovation Life發表了題為“NaRaDa: A comprehensive nascent RNA database”的文章，構建了綜合性的新生RNA數據庫NaRaDa（http://www.narada.bio）。

對基因組轉錄調控的動態解析是解讀細胞命運和疾病發生機制的關鍵。傳統RNA測序技術受限于高豐度穩態RNA，難以捕捉轉錄活動的即時變化。近年來，新生RNA測序技術的發展，為實時監測轉錄動態提供了關鍵工具。相較于傳統RNA測序技術，新生RNA測序技術可以從三個層面提供轉錄調控信息，包括新生RNA即時表達情況，轉錄暫停情況以及非編碼轉錄調控元件的活躍情況。

研究人員收集并整理了3664個新生RNA測序數據集，涵蓋22個物種、415項研究，構建了新生RNA數據庫，并提供樣本質控信息，確保用戶可篩選高質量數據集。NaRaDa還鑒定了558,574個來自不同物種的轉錄調控元件，用戶既可以通過感興趣的基因來探索，也可以通過篩選具有特定處理或實驗條件的項目來獲取其對應的調控元件。NaRaDa支持用戶在線分析不同新生RNA數據集的轉錄調控變化，包括新生RNA表達差異、RNA聚合酶的暫停/釋放轉變以及轉錄調控元件的活躍程度變化。用戶可以下載、利用這些信息，深入剖析基因和調控元件在各種情況下的轉錄動力學。

總的來說，這項研究構建了綜合性的新生RNA數據庫，為解析轉錄起始變化、RNA代謝動力學及基因調控網絡提供了資源寶庫。

廣州健康院鮑習琛研究員為該論文的通訊作者，博士后麥志標、博士生李鐸為共同第一作者。相關工作得到國家重點研發計劃、國家自然科學基金委等項目的資助。

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圖1?NaRaDa的整體框架